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合作社裡賣得最好的是已有16年歷史的薄鹽醬油，由前食品科學系主任謝寶全研發，前身是屏東農專生產的「學府醬油」，以傳統古法釀製，因為太鹹，不太受歡迎，最後找出投入乳酸菌的方法，改良出薄鹽醬油。
薄鹽醬油除了低鹽外，還以紅麴素代替一般使用的焦糖色素，開瓶後不放冰箱一定會腐壞的「見證」，很快的從校內紅到校外。
在許多民眾要求下，民國94年屏科大對外開放員工消費合作社，買薄鹽醬油的人是整箱整箱的搬，除了自用外，還拿來當禮盒送人，還有人大批購買，放在店裡賣，連高雄市的民眾都來搶購。
約4年前，高屏縣市幾名醫生看中強調健康取向的薄鹽醬油，於是合資組成屏大生技公司向屏科大購買釀造技術，技術轉移金新台幣1000萬元左右。
技術轉移後的薄鹽醬油和醬油膏，產品仍由謝寶全輔導監製，除了宅配外，販賣地點仍只在屏科大員工消費合作社，1年可為屏科大合作社創下營業額3500到4000萬元。
屏科大員工消費合作社理事主席邱武霖表示，雖然屏科大員工消費合作社年營業總額約7000多萬元，但扣掉成本、稅賦及人事費等，屬於合作社福利基金的淨利不到1成。
邱武霖說，本來員工消費合作社的初衷就是照顧學校師生，不以賺錢為目的，利潤「嘸要緊啦！」。
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